La compagnie aérienne nationale de la Namibie, Air Namibia (SW), est basée à Windhoek, avec des hubs à l'aéroport international Hosea Kutako (WDH) et à l'aéroport de Windhoek Eros (ERS). Air Namibia propose des vols vers huit destinations intérieures ainsi que l'Angola, le Botswana, l'Allemagne, l'Afrique du Sud, la Zambie et le Zimbabwe. Elle a également un accord de partage de codes avec Kenya Airways (KQ). Sa flotte inclut des avions Airbus A319-100, Airbus A330-200 et Embraer ERJ 135 avec des configurations d'une cabine (Classe Économique) et deux cabines (Classe Prestige, Affaires et Économique).